ФЕДЕРАЛЬНАЯ СЛУЖБА ПО НАДЗОРУ В СФЕРЕ ЗАЩИТЫ ПРАВ ПОТРЕБИТЕЛЕЙ И БЛАГОПОЛУЧИЯ ЧЕЛОВЕКА


Об основных итогах работы ФБУН Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии имени Пастера Роспотребнадзора в 2021 году


3 января 2022 г.

         В 2021 году приоритетным направлением научной и практической деятельности ФБУН Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии имени Пастера Роспотребнадзора оставалось изучение новой коронавирусной инфекции и её последствий. Следует отметить, что ряд научных изысканий проводилось совместно с другими научными учреждениями.

Среди основных научных наработок можно отметить следующие: молекулярно-генетический мониторинг и изучение происхождения SARS-CoV-2; изучение роли цитокинов в иммунопатогенезе COVID-19 и постковидного синдрома; поиск иммунологических биомаркеров чувствительности и устойчивости к развитию инфекции, вызванной SARS-CoV-2 и др.

В 2021 году продолжена работа по исследованию популяционного иммунитета к SARS-CoV-2 у населения Российской Федерации, проводимое с июня 2020 года совместно с 7 научными институтами и 20 территориальными управлениями Роспотребнадзора.

Представитель ФБУН Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии имени Пастера Роспотребнадзора – заместитель директора по научной работе Дедков В.Г. – в составе международной группы экспертов ВОЗ в январе 2021 года проводил исследовательские работы по изучению происхождения SARS-CoV-2 в Ухане (Китай).

 

 

1.       Молекулярно-генетический мониторинг и изучение происхождения SARS-CoV-2

 

Впервые был описан новый вариант SARS-CoV-2 с отчетливыми мутациями спайкового белка идентифицированный в конце января 2021 года на Северо-Западе России. Основные мутации включают: Делецию 27 нуклеотидов, 9 аминокислот в составе домена S1, а также Инсерцию 12 нуклеотидов, 4 аминокислот на границе доменов S1 и S2. В феврале сиквенс был зарегистрирован в GISAID, в дальнейшем штамм получил название АТ.1, и в начале июля ВОЗ включила его в список штаммов подлежащих наблюдению. В настоящее время он полностью вытеснен индийским штаммом, хотя единичные находки сохраняются до сих пор.

 

Публикации:

 

Gladkikh A, Dolgova A, Dedkov V, Sbarzaglia V, Kanaeva O, Popova A, Totolian A. Characterization of a Novel SARS-CoV-2 Genetic Variant with Distinct Spike Protein Mutations. Viruses. 2021; 13(6):1029. https://doi.org/10.3390/v13061029 (Web of Science, Q1)

 

 

 

2.       Изучение роли цитокинов в иммунопатогенезе COVID-19 и постковидного синдрома

 

Впервые показано, что фаза реконвалесценции характеризуется значительно сниженным уровнем цитокинов, которые регулируют дифференцировку клеток, гемопоэз, в особенности лимфоцитарное звено (Т-лимфоциты, NK-клетки).

В случае развития инфекции поиск иммунологических биомаркеров тяжелого течения и/или летального исхода COVID-19. Из числа 48 изученных цитокинов впервые показана прогностическая значимость содержания 4 цитокинов в плазме крови (IL-6, IL-8, IL-15, IL-18), причем комбинация двух из них (IL-6 и IL-18) обладает максимальной информативностью, которая составляет 97%.

 

Публикации:

 

1. Арсентьева Н.А., Любимова Н.Е., Бацунов О.К., Коробова З.Р., Станевич О.В., Лебедева А.А., Воробьев Е.А., Воробьева С.В., Куликов А.Н., Лиознов Д.А., Шарапова М.А., Певцов Д.Э., Тотолян А.А. Цитокины в плазме крови больных COVID-19 в острой фазе заболевания и фазе полного выздоровления. Медицинская иммунология. 2021;23(2):311-326. https://doi.org/10.15789/1563-0625-PCI-2312 (Scopus)

2. Bakin EA, Stanevich OV, Chmelevsky MP, Belash VA, Belash AA, Savateeva GA, Bokinova VA, Arsentieva NA, Sayenko LF, Korobenkov EA, Lioznov DA, Totolian AA, Polushin YS and Kulikov AN (2021) A Novel Approach for COVID-19 Patient Condition Tracking: From Instant Prediction to Regular Monitoring. Front. Med. 8:744652. doi: 10.3389/fmed.2021.744652 (Web of Science, Q1)

3. Natalia Arsentieva, Natalia Liubimova, Oleg Batsunov, Zoia Korobova, Raisa Kuznetsova, Artem Rubinstein, Oksana Stanevich, Aleksandra Lebedeva, Evgeny Vorobyov, Alexandr Kulikov, Elena Gavrilova, Yuri Polushin, Irina Shlyk, Areg Totolian Predictive value of specific cytokines for lethal COVID-19 outcome Cytokine (Manuscript Number: CYTO-21-845) in press (Web of Science, Q2)

 

  

3.       Поиск иммунологических биомаркеров чувствительности и устойчивости к развитию инфекции, вызванной SARS-CoV-2

 

Совместно с Санкт-Петербургским НИИ гематологии и трансфузиологии в результате наблюдения за когортой доноров костного мозга (Санкт-Петербург) показано, что:

·     Группы HLA-аллелей А*02 и А*26 являются протективными иммуногенетическими факторами в отношении развития заболевания, вызванного вирусом SARS-CoV-2, среди жителей Северо-Запада России

·     Группа аллелей HLA-А*29 является предрасполагающим иммуногенетическим фактором в отношении данного заболевания.

Предварительные результаты опубликованы в журнале «Медицинская иммунология» (Scopus). Полученные данные подтверждены на независимой выборке. В настоящее время готовится публикация в журнал «Viruses (Switzerland)» (Web of Science, Q1)

 

Публикация:

 

Бубнова Л.Н., Павлова И.Е., Беркос А.С., Терентьева М.А., Глазанова Т.В., Ерохина Л.В., Беляева Е.В., Чечеткин А.В., Башкетова Н.С., Чхинджерия И.Г., Кожемякина М.А., Азаров Д.В., Кузнецова Р.Н., Тотолян А.А. Особенности распределения групп аллелей HLA-А*, B*, DRB1* среди лиц, перенесших COVID-19. Медицинская иммунология. 2021;23(3):523-532. https://doi.org/10.15789/1563-0625-DPO-2334 (Scopus)

 

4.     Оценка популяционного иммунитета к SARS-CoV-2

 

В Российской Федерации данное исследование проводится с июня 2020 года совместно с 7 научными институтами и 20 территориальными управлениями Роспотребнадзора

·          Разработана методология и создана эффективно работающая система серологического мониторинга по оценке уровня популяционного иммунитета в разных регионах РФ для прогнозирования эпидситуации, выработки рекомендаций, планирования вакцинации

·          В 26 регионах РФ с июня 2020 года по настоящее время проведено 5 этапов популяционного исследования, в ходе которого установлены основные закономерности формирования коллективного иммунитета на разных этапах развития эпидемии

·          Проведена оценка вклада поствакцинального иммунитета в формирование коллективного иммунитета

·          Данная методология внедрена в практику санитарной службы на трансграничных территориях: Беларусь (13 тысяч волонтеров) и Киргизия (9,5 тысяч волонтеров)

·          Вакцинация препаратом «Спутник V» лиц, перенесших инфекцию в бессимптомной форме (доля серонегативных 0,4%) иммунологически в 9 раз более эффективна, нежели вакцинация лиц без серологических маркеров перенесенной инфекции (доля серонегативных 3,6%). При вакцинации переболевших или лиц, перенесших инфекцию в бессимптомной форме, формируется «гибридный иммунитет».

·           

Публикации:

 

По данной теме опубликованы 22 статьи в ведущих российских журналах эпидемиологического и иммунологического профиля, представленных в Scopus и Web of Science, а также в журнале «Viruses (Switzerland)»

1.       Педиатрия. 2021. Т. 100, № 3. С. 97-106. doi.org/10.24110/0031-403X-2021-100-3-97-106 (Scopus)

2.       Инфекция и иммунитет. 2021. Т. 11, № 2. С. 297-323. doi.org/10.15789/2220-7619-FOD-1684 (Web of Science)

3.       Инфекционные болезни. 2020. Т. 18, № 1. С. 8-16. doi.org/10.20953/1729-9225-2020-4-8-16 (Scopus)

4.       Журнал инфектологии. 2020. Т. 12, № 5. С. 62-71. doi.org/10.22625/2072-6732-2020-12-5-62-71 (Scopus)

5.       Проблемы особо опасных инфекций. 2020. № 3. С. 106-113. doi.org/10.21055/0370-1069-2020-3-106-113 (Scopus)

6.       Проблемы особо опасных инфекций. 2020. Т. 3. С. 124-130. doi.org/10.21055/0370-1069-2020-3-124-130 (Scopus)

7.       Эпидемиология и инфекционные болезни. Актуальные вопросы. 2021. Т.11, № 2. С.29-35 doi.org/10.18565/epidem.2021.11.2.29-35 (Scopus)

8.       Проблемы особо опасных инфекций. 2020. № 3. С. 114-123. doi.org/10.21055/0370-1069-2020-3-114-123 (Scopus)

9.       Проблемы особо опасных инфекций. 2020, № 4. С. 106-116. doi.org/10.21055/0370-1069-2020-4-106-116 (Scopus)

10. ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2021. Т. 13, № 1. С. 17-27. doi.org/10.22328/2077-9828-2021-13-1-17-37 (Scopus)

11. Инфекционные болезни. 2020. Т. 18, № 4. С. 17-26. doi.org/10.20953/1729-9225-2020-4-17-26 (Scopus)

12. Проблемы особо опасных инфекций. 2020. № 4. С. 117-124. doi.org/10.21055/0370-1069-2020-4-117-124 (Scopus)

13. Эпидемиология и инфекционные болезни. 2021. Т. 11, № 1. С. 18-24. doi.org/10.18565/epidem.2021.11.1.18-24 (Scopus)

14. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2020. Т. 97, № 6. С. 518-528. doi.org/10.36233/0372-9311-2020-97-6-2 (Scopus)

15. Acta Biomedica Scientifica. 2021; 6(3): 227-238. https://doi.org/10.29413/ABS.2021-6.3.23 (Scopus)

16. Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2021. Т. 20, № 3, С. 8-18 https://doi.org/10.31631/2073-3046-2021-20-3 (Scopus)

17. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2020. Т.97, №5. С.392-400. doi.org/10.36233/0372-9311-2020-97-5-1 (Scopus)

18. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2021. Т. 98, № 1. С. 7-17. doi.org/10.36233/0372-9311-92 (Scopus)

19. Инфекция и иммунитет. 2021;11(4):609-616. doi.org/10.15789/2220-7619-MFA-1770 (Web of Science)

20. Вопросы вирусологии. 2021; 66(4): 299-309. doi.org/10.36233/0507-4088-54 (Scopus)

21. Инфекция и иммунитет. 2021;11(5):887-904. https://doi.org/10.15789/2220-7619-HIT-1798 (Web of Science)

22. Viruses, 2021, vol. 13, no. 8: 1648. doi.org/10.3390/v13081648 (Web of Science, Q1)

 


 

5.     Исследовательские работы по изучению происхождения SARS-CoV-2

 

В составе международной группы экспертов ВОЗ (В.Г. Дедков) с января 2021 года проводятся исследовательские работы по изучению происхождения SARS-CoV-2. Определены приоритетные направления исследований. Показана высокая вероятность естественного происхождения вируса. В качестве резервуара вируса рассматриваются представители семейства рукокрылых.

 

Публикации:

 

Koopmans M, Daszak P, Dedkov VG, Dwyer DE, Farag E, Fischer TK, Hayman DTS, Leendertz F, Maeda K, Nguyen-Viet H, Watson J. Origins of SARS-CoV-2: window is closing for key scientific studies. Nature. 2021 Aug;596(7873):482-485. doi: 10.1038/d41586-021-02263-6. PMID: 34433937. (Web of Science, Q1)

 




 

Главная | Cписок новостей